Extracción de ADN total de formas silvestres de Phaseolus vulgaris L., con el método CTAB
Extraction of total DNA from wild forms of Phaseolus vulgaris L., with the CTAB method
DOI:
https://doi.org/10.54167/tch.v18i1.1374Palabras clave:
proteinasa K, frijol común silvestre, enzimas, ADN, purezaResumen
Uno de los principales objetivos de la extracción de ADN es obtener material con alta pureza y en cantidad suficiente. Se han reportado métodos para aislar ADN total a partir de tejido foliar de Phaseolus vulgaris. Sin embargo, la alta variabilidad genética, la cual se manifiesta en diferentes capacidades de acumulación de carbohidratos y compuestos fenólicos, dificulta los procesos de extracción de ADN. En el presente estudio se evaluó la eficiencia de extracción de ADN foliar de dos métodos basados en el uso de CTAB. Se usaron dos métodos: método 1, el cual incluyó el uso de Proteinasa K y RNAsa y el método 2, sin las enzimas. El método 1, permitió obtener entre 115.55 y 1138.23 ng/μL de ADN, en cambio el método 2, permitió obtener mayor cantidad de ADN, entre 354.90 y 2513.10 ng/μL. La amplificación por PCR de marcadores ISTR generó bandas mejor resueltas en las muestras de ADN obtenidas con el método 2 que con el método 1. El método 2 es efectivo y económico para obtener ADN en cantidad y calidad adecuadas de genotipos silvestres de P. vulgaris, que puede ser usado en estudios moleculares.
Descargas
Citas
Addinsoft. (1995-2024). XLSTAT. Statistical Software. BroNY, USA: Addinsoft, Inc. https://www.xlstat.com/en/
Aboul, M. N. A. F. & Oraby, H. A. S. (2019). Extraction of high-quality genomic DNA from different plant orders applying a modified CTAB-based method. Bulletin of the National Research Centre 43: 25. https://doi.org/10.1186/s42269-019-0066-1
Andrews, A. T. 1994. Electrophoresis of nucleic acids. In: T. A. Brown (Ed.) Essential Molecular Biology. A Practical Approach. IRL Press, 89-106. ISBN-10: 0-19-963644-3
Ángel, G. J. (1996). La variación y su significado. Revista Universidad Eafit, 101: 87-96. https://goo.su/y9cd
Castellanos, H. O. A., Lépiz, I. R., Castellanos, E. G. E., Rodríguez, S. A. & Torres, M. M. I. (2017). Relaciones genéticas basadas en marcadores ISTR entre formas silvestres, cultivadas e intermedias de frijol de guía colectado en Jalisco, México. Acta Botánica Mexicana 118: 53-63. https://doi.org/10.21829/abm118.2017.1200
CEDRSSA. (2019). Centro de Estudios para el Desarrollo Rural Sustentable y la Soberanía Alimentaria. Mexico's reliance on key grains like maize, beans, rice, and wheat is governed by the Ley de Desarrollo Rural Sustentable (Law of Sustainable Rural Development) https://goo.su/u0up
Chan, S. Y., Bernard, H. U., Ong, C. K., Chan, S. P., Hofmann, B. & Delius, H. (1992). Phylogenetic analysis of 48 papillomavirus types and 28 subtypes and variants: a showcase for the molecular evolution of DNA viruses. Journal of Virology 66 (10): 5714-5725. https://doi.org/10.1128/jvi.66.10.5714-5725.1992
Coelho, R. C., Faria, M. A., Rocha, J., Reis, A., Oliveira, P. P. & Nunes, E. (2009). Assessing genetic variability in germplasm of Phaseolus vulgaris L. collected in Northern Portugal. Scientia Horticulture 122(3): 333-338. https://doi.org/10.1016/j.scienta.2009.05.035
Curay, P. J. D. (2019). Evaluación agronómica de tres variedades de Fréjol arbustivo (Phaseolus vulgaris L.) bajo las condiciones climáticas de la comunidad de Rumichaca del cantón Pelileo. (Bachelor's thesis). Universidad Técnica de Ambato Facultad de Ciencias Agropecuarias. Cevallos, Ecuador. http://repositorio.uta.edu.ec/jspui/handle/123456789/30037
Debouck, D. G. (2020). La agricultura en Mesoamérica. Organización de las Naciones Unidas para la Agricultura y la Alimentación (FAO). https://www.fao.org/3/cb1447es/cb1447es.pdf
De Jesús, R., Rodríguez, N., Torres, W., Moreno, Y. & O'Callaghan, J. (2011). Uso de marcadores moleculares microsatélites para determinar condición de homocigosis y heterocigosis en roedores producidos en el Bioterio de la Universidad de Los Andes, Venezuela. Avances en Investigación Agropecuaria 15 (2): 45-63. https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=83719236004
Fernández, G. L. (2023). Desarrollo de métodos de referencia para la cuantificación de citosinas metiladas en fragmentos de ADN. (Tesis Maestría). Universidad de Oviedo, España. https://hdl.handle.net/10651/69159
Freytag, G. F. & Debouck, D. G. (2002). Taxonomy, distribution, and ecology of the genus Phaseolus (Leguminosae-Papilionoideae) in North America, Mexico and Central America. Sida, Botanical Miscellany 23. Botanical Research Institute of Texas, USA. https://hdl.handle.net/10568/54291
Guzmán, R. L. F., Cortés, C. M. A., Pichardo, G. J. M. & Arteaga, G. R. (2018). Comparación de protocolos de aislamiento de DNA a partir de semilla de soya. Revista Mexicana Ciencias Agrícolas 9(8): 1691-1701. https://doi.org/10.29312/remexca.v9i8.872
Lépiz, I. R., López, J. A., Sánchez, J. J. G., Santacruz, D. E., Romero, E. N. & Rodríguez, E. G. (2010). Características morfológicas de formas cultivadas, silvestres e intermedias de frijol común de hábito trepador. Revista Fitotecnia Mexicana 33(1): 21-28. https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=61012290003
Mateo, S. B. F. (2016). Selección de líneas de frijol (Phaseolus vulgaris L.) que combinan resistencia al gorgojo común (Acanthoscelides obtectus Say) con resistencia a los virus BGYMV, BCMV y BCMNV (Disertación Doctoral). Universidad de Puerto Rico https://hdl.handle.net/20.500.11801/42
Mellado, O. M. S. (2020). Técnicas de biología molecular en el diagnóstico de enfermedades infecciosas. NPunto, 3 (30): 88-111. Mellado, O. M. S. (2020). Técnicas de biología molecular en el diagnóstico de enfermedades infecciosas. NPunto, 3 (30): 88-111. https://goo.su/EjFik
Miranda, L. S., Rosas, S. J. C., Aranda, R. L. L., Ortiz, P. R., Ponce, B. M. & Ríos, L. H. (2006). Análisis molecular de la diversidad genética de frijol común manejada por campesinos en Cuba. Agronomía Mesoamericana 3(17): 369-382. https://doi.org/10.15517/am.v17i3.5172
Osorio, Z. M. A., Infante, D. & Molina, S. (2006). Variación genética asexual en Agave cocui Trealease. Boletin Nakari, 17: 1-7.
Pech, M. H. (2020). Flujo genético e introgresión entre poblaciones domesticadas y silvestres del frijol lima (Phaseolus lunatus L.) en la península de Yucatán, México. (Tesis de Maestría, Mauricio Heredia Pech) Pech, M. H. (2020). Flujo genético e introgresión entre poblaciones domesticadas y silvestres del frijol lima (Phaseolus lunatus L.) en la península de Yucatán, México. (Tesis de Maestría, Mauricio Heredia Pech). http://cicy.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1003/1859
Reyes, M. A., Barriada, B. L. G., Rivera, R. D. M., Pajarito, R. A., Delgado, A. E. A., Almaraz, A. N., Herrera, C. J., Uribe, S. J. N. & Naranjo, J. N. (2011). Comparación de dos métodos para obtener ADN total de Phaseolus vulgaris para análisis de ISTR. Vidsupra 3(1): 23-29. http://www.repositoriodigital.ipn.mx/handle/123456789/8247
Reyes, M. A. (2014). Variabilidad genética de frijol Phaseolus vulgaris L. cultivado y silvestre en el estado de Durango (Disertación Doctoral, Reyes Martínez Alfonso). http://www.repositoriodigital.ipn.mx/handle/123456789/21641
Ríos, D. K., Viteri, S. E. & Delgado, H. (2014). Evaluación agronómica de líneas avanzadas de fríjol voluble Phaseolus vulgaris L. en Paipa, Boyacá. Revista de Ciencias Agrícolas 31(1): 42-54. https://dialnet.unirioja.es/servlet/articulo?codigo=5104175
Rojas, L. E., Reyes, M., Pérez, A. N., Olóriz, M. I., Posada, P. L., Ocaña, B., y Pérez, J. L. P. (2014). Extracción in situ de ADN genómico para el análisis por PCR de regiones de interés en cuatro especies vegetales y un hongo filamentoso. Biotecnología Vegetal, 14(3): 151-154. https://revista.ibp.co.cu/index.php/BV/article/view/70
Saburido, M., y Herrera, A. (2015). El frijol en la Era Genómica. RDU. Revista Digital Universitaria, 16 (2). Disponible en: https://www.revista.unam.mx/vol.16/num2/art11/
Sambrook, J., Fritish, E. F. & Maniatis, T. (2001). Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Vol 1. Cold Spring Harbor Laboratory Press, USA. https://goo.su/s27SJU
Shagai, M. M. A., Soliman, K. M., Jorgensen, R. A. & Allard, R. W. (1984). Ribosomal DNA spacer length polymorphism in barley: Mendelian inheritance, chromosomal location and population dynamics. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (81)24: 8014-8018. https://doi.org/10.1073/pnas.81.24.8014
Wallander, C. L., Almaraz, A. N., Alejandre, I. G., Uribe, S. J. N., Ávila, R. J. A., Torres, R. R., Herrera, A.Y. & Delgado, A. E. A. (2022). Variación fenológica y morfométrica de Phaseolus vulgaris (Fabaceae) de cinco poblaciones silvestres de Durango, México. Botanical Sciences, 100 (3): 563-578. https://doi.org/10.17129/botsci.2981
Publicado
Cómo citar
-
Resumen417
-
PDF315
-
HTML11
